Raziskovalci so izdelali doslej najobsežnejši zemljevid mikroorganizmov na Velikem koralnem grebenu. Podatki bi lahko pomagali zaznati poslabšanje stanja grebena, še preden postanejo posledice vidne na koralah.
Veliki koralni greben ni le dom koral, rib in morskih želv. V njegovi vodi živi izredno raznolika skupnost bakterij, arhej, virusov in drugih mikroskopskih organizmov, ki vzdržujejo prehranske verige ter vplivajo na kroženje ogljika in hranil.
Znanstveniki so zdaj analizirali vzorce morske vode z 48 območij vzdolž grebena in pripravili novo zbirko mikrobnih genomov. Med 876 prepoznanimi vrstami bakterij in arhej jih kar 584 oziroma skoraj 67 odstotkov doslej ni bilo zastopanih v veliki mednarodni zbirki oceanskih mikroorganizmov.
Rezultati raziskave so bili objavljeni v reviji Nature.
Več kot 800.000 virusnih genomov
Raziskovalci so iz vzorcev sestavili 5.283 genomov bakterij in arhej, poleg njih pa še 808.585 virusnih genomov ter 20 skoraj popolnih genomov drobnih evkariontskih organizmov.
Pri tem so povezali dve metodi določanja zaporedja DNK. Dolgi odčitki so jim omogočili sestavljanje večjih delov genomov, kratki pa so izboljšali njihovo natančnost. Tako pridobljeni genomi so bili približno 29-krat bolj povezani kot pri uporabi zgolj kratkih odčitkov.
Odkritje še ne pomeni, da vseh 584 vrst najdemo izključno na Velikem koralnem grebenu. Nekatere lahko živijo tudi drugje, a jih zaradi tehničnih omejitev prejšnjih raziskav doslej niso uspešno rekonstruirali.
Mikrobi razkrivajo vpliv ribolova
Analiza je pokazala, da se mikrobne skupnosti razlikujejo med zaščitenimi območji, kjer je ribolov prepovedan, in območji, odprtimi za ribolov. Računalniški model je lahko na podlagi sestave mikrobioma s približno 75-odstotno natančnostjo določil, ali vzorec prihaja z zaščitenega grebena.
“Spremembe v mikrobnih skupnostih pogosto opazimo, še preden se pokažejo vidne spremembe na grebenu,” je za The Guardian pojasnil raziskovalec Yun Kit Yeoh.
Nova zbirka tako predstavlja izhodiščno stanje, s katerim bo mogoče primerjati prihodnje vzorce. Mikrobi bi lahko postali nekakšen zgodnji opozorilni sistem za posledice onesnaženja, ribolova, segrevanja morja in beljenja koral.
